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一、病原物病害
1、馬蹄稈枯病：該病俗稱"馬蹄瘟"，廣泛分布于馬蹄產區，植株感病后地下莖不結薺或結小薺。初生病斑暗綠色水漬狀，不規則形或近圓形，略凹陷，以后病斑呈暗綠至灰褐色，梭形或橢圓形，上生黑褐色小點。小病斑擴展連合成不規則的大病斑后，可造成莖稈枯死倒伏，呈淺黃色稻草狀。早晨露水未干或濕度大時，病斑表面可見大量淺灰色霉層。病原分生孢子可進行再侵染危害。此病一般在8月中旬開始發病，發病高峰為9月中、下旬，田間濕度大有利于該病發生。
2、馬蹄枯萎病：該病是馬蹄主要病害之一，整個生長季節均可發病，尤以9月中旬至10月嚴重。其癥狀有青枯型和枯斑型。⑴青枯型表現為從稈端或一側失水呈青枯狀，并向下擴展，后整稈枯死，尤其在雨后天晴時，其癥狀在田間為明顯。病株一般不結薺或結白薺，危害較大。⑵枯斑型一般比青枯病型發病遲，一般在9月下旬以后。表現癥狀：馬蹄稈中上部呈現灰白色枯斑，病健分界十分明顯，略凹陷，病斑間可相互連合成大斑。病株發育一般較正常，危害較小。
3、馬蹄莖腐病：該病一般在9月份盛發，發病的葉狀莖外觀癥狀為枯黃至褐黃色，病莖較短而細，發病部位多數在葉狀莖的中下部、病部初呈暗灰色，后為暗色不規則病斑，病健分界不明顯，且病部組織變軟易折斷，濕度大時，病部可產生暗色稀疏霉層。
二、生理性病害
通常表現為生理性紅尾，其癥狀主要是紅尾不干苗或只在頂端的一小節莖稈上干枯。該病多發生在8—9月初，產生的原因是多年種植馬蹄的土壤缺少硼、鋅、鐵、錳等微量元素。
三、蟲害的識別
白禾螟（又稱白螟）：是危害馬蹄的主要害蟲，幼蟲咬食莖稈基部，被害初期，馬蹄莖稈頂端由綠轉黃，莖稈上能找到蟲孔，剖開莖稈可見內有蟲道、蟲糞及灰白色幼蟲。若蛀入莖稈的幼蟲多或蟲齡大，則數天內莖稈由上至下黃化枯死，呈桔黃色，但不像病害那樣有病斑或青枯。莖稈轉黃枯死后，幼蟲轉移危害。
四、綜合防治
1、病原物病害的防治：⑴預防為主。每畝用細硫磺粉4—5公斤+50%多菌靈0.5公斤+75%敵克松可濕性粉劑0.5公斤分別結合施肥或單獨與細泥或細砂15—20公斤配成菌土，在8月中旬、9月中旬各施一次，對預防上述三種病原物病害的發生都有良好的效果。⑵種植田塊應采取輪作。田塊宜小，大塊田應分隔成適當小塊，分開排灌，杜絕串灌、漫灌，以防病菌隨流水擴散。⑶適期噴藥防治。在生長期間隨時檢查，發現病株及時防治。稈枯病或枯萎病可用50%多菌靈600倍液+70%甲基托布津800倍液+100萬單位獸用硫酸鏈霉素12500倍液或12.5%敵力康2000倍液噴施；莖腐病可用40%五氯硝基苯粉劑500—600倍液噴灑。每隔7—10天噴一次，連噴3—4次，也可視病情輕重增減施藥次數。
2、生理性病害的防治：每畝撒施硼砂、硫酸鋅各2公斤，葉面噴施"十元素硼肥"100克+磷酸二氫鉀150克對水50—60公斤噴莖葉，每隔5—7天噴1次，連噴2—3次即可。
3、常見蟲害的防治：白螟主要是以第三、第四代幼蟲危害馬蹄，發生期在8月上旬至9月下旬，世代重疊嚴重，難以噴藥防治，必須采取上噴下悶的辦法才能奏效。具體措施：
在成蟲盛發期每畝用進口呋喃丹3—4公斤或米爾樂1.5—2公斤或20%甲基異柳磷乳油0.4公斤+20%三唑磷乳油0.4公斤與細泥或細砂15—20公斤拌成毒土撒施。同時在第三、四代白螟孵化高峰后1—2天，用18%殺蟲雙水劑300—400倍液+90%晶體敵百蟲800倍液或20%三唑磷乳油500—600倍液+20%甲基異柳磷乳油500—600倍液噴霧防治。
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